Après l'expo de 2712, le régime Messer a cherché à utiliser la popularité de l'IAE pour faire avancer son programme et a commencé à proposer des idées à ses dirigeants, qui les ont accommodés sur des questions mineures mais ont ignoré la majorité des demandes. Quelques années plus tôt, en 2704, Timmerman avait créé une organisation à but non lucratif pour superviser l'IAE et s'assurer que les bénéfices iraient à des oeuvres de charité après son départ. Elle espérait également que la création d'un conseil d'administration permettrait d'éviter les influences politiques et commerciales abusives. Cela a fonctionné jusqu'en 2715, lorsque le gouvernement local de Lo a refusé d'autoriser l'exposition en raison de problèmes de sécurité inventés de toutes pièces. Lorsque Timmerman et le conseil d'administration de l'IAE ont rencontré les responsables locaux pour discuter des problèmes, un médiateur du régime Messer s'est également joint à eux et a clairement indiqué les changements attendus pour que l'événement soit autorisé. Mme Timmerman a refusé d'obtempérer et s'est officiellement retirée de l'organisation de l'événement au lieu d'affronter les répercussions promises à son encontre et à celle de l'exposition.
Pendant les décennies qui ont suivi, le conseil d'administration de l'IAE était composé de fidèles des Messer qui ont lentement fait plier l'événement à la volonté du régime. L'exposition est devenue plus exclusive, la plupart des espaces d'exposition étant réservés aux entreprises de navires et de composants en règle avec le régime. Il n'était pas rare que les petits fabricants ou ceux qui n'avaient pas la cote soient obligés de verser d'importants pots-de-vin aux membres du conseil d'administration avant de se voir attribuer un espace. En 2725, l'IAE a commencé à demander aux invités de s'inscrire à l'événement en remplissant un long formulaire comprenant un serment de loyauté envers l'Empire que de nombreux activistes et critiques ont refusé de signer. Bien que l'entrée soit restée gratuite, un système de billetterie a permis aux organisateurs de l'événement de choisir qui pouvait assister à l'exposition et à quel moment, ce qui a suscité un vif intérêt de la part de la population.
Aegis Dynamics et ses navires militaires ont dominé cette ère de l'IAE. Le fabricant préféré du régime est devenu si important que certains ont commencé à appeler l'exposition l'Intergalactic Aegis Expo. Parmi les événements mémorables de cette époque, citons l'année 2736, où une controverse a éclaté à propos de l'utilisation d'images de combats spatiaux sur le front de Vanduul dans une vidéo patriotique diffusée en boucle à l'exposition. L'événement de 2754 est devenu célèbre en raison de son caractère exclusif. Il comprenait une salle d'exposition spéciale à laquelle seuls certains invités pouvaient accéder après un contrôle de sécurité strict. À l'intérieur se trouvait un vaisseau militaire top secret caché sous une bâche géante qui ne révélait que sa silhouette unique. Des années plus tard, le navire a été déclassifié et s'est révélé être le Vanguard d'Aegis.
La tendance nationaliste de l'expo s'est maintenue jusqu'à la chute du régime en 2792. Dans le chaos du soulèvement, tous les directeurs de l'IAE ont été arrêtés ou ont fui. Beaucoup se demandaient si, pour la première fois dans l'histoire de l'événement, l'IAE serait annulée. Heureusement, une coalition de fabricants de navires et de composants est intervenue pour financer l'événement et a travaillé avec les responsables locaux de Lo pour qu'il ait lieu. Ce partenariat a permis de sauver l'exposition et de lancer la phase suivante.